В фондах музея широко представлены предметы, которые отражают различные этапы развития истории науки и техники судостроения: детали судов, механизмы, средства управления судном, приборы, средства навигации, а также другие технические устройства, раскрывающие творческую деятельность ученых, инженеров и изобретателей, иллюстрирующие характерные особенности технического дизайна.
Многие предметы имеют большую историческую ценность: штурвал на рулевой колонке, находящийся в подлинной ходовой рубке легендарного ледореза «Ф. Литке»; бинокль Н.М. Николаева, капитана ледореза; машинный телеграф, осуществляющий связь командного мостика с машинным отделением; навигационные приборы, с помощью которых штурман выполнял прокладку маршрута судна по безбрежным морским просторам.
Богатым разнообразием отличается коллекция судовых, измерительных и оптических приборов, средств навигации, управления и связи. В собрании музея имеются различные образцы якорей, среди которых якорный камень, а также классические адмиралтейские якоря и современные модификации якоря Холла.